Факультет розпочав своє існування в 1932 р. у колишньому Київському інституті механізації та електрифікації сільського господарства.

Засновником його і першим деканом був професор С.І. Іноземцев. Згодом цю посаду займали доценти Г.Г. Кустовський, М.Г. Гольдштейн, Л.К. Головінський, В.П. Коваленко, О.Д. Краверс, В.М. Гайдук, І.П. Притака, Л.П. Тищенко, професори В.І. Мішин, І.І. Мартиненко, Т.П. Резніченко, М.Т.Лут.

У 2002 р. відбулася зміна структури НАУ. Факультет та центр енергетики і автоматизації АПК (об’єднує п’ять кафедр) увійшли до структурного підрозділу НАУ — навчально-наукового технічного інституту. Деканом факультету призначено доцента І.П.Радько, а директором центру — професора В.В.Козирського.

З 2004 року факультет та центр проводять підготовку фахівців за чотирьма спеціальностями:
енергетика сільськогосподарського виробництва;
електрифікація та автоматизація сільського господарства;
електротехнічні системи електроспоживання;
автоматизоване управління технологічними процесами;

Перший випуск інженерів-електриків (34 особи) факультет здійснив у 1936р. 3 початком Великої Вітчизняної війни в липні 1941 р. факультет був евакуйований до м. Алмаати і увійшов до складу Казахського державного сільськогосподарського інституту. Тут було підготовлено 41 інженера-електрика. При лабораторії кафедри електричних машин була організована майстерня з ремонту електрообладнання автомобілів Багато вихованців факультету зі зброєю в руках боронили рідну землю від фашистської навали.

Після повернення із Середньої Азії факультет почав працювати в складі Київського сільськогосподарського інституту, пізніше — в Українській сільськогосподарській академії, нині діє у Національному аграрному університеті.

У 1973 р. на факультеті була розпочата підготовка спеціалістів за фахом «Автоматизація сільськогосподарського виробництва» поряд з іншим «Електрифікація сільського господарства». Нині на факультеті електрифікації" та автоматизації сільського господарства провадиться підготовка фахівців освітньо-кваліфікаційних рівнів бакалавр, спеціаліст і магістр. Зі спеціальностей «Енергетика сільськогосподарського виробництва» та «Автоматизоване управління технологічними процесами і виробництвами».

На факультеті працює висококваліфікований професорсько-викладацький колектив, до складу якого зокрема входять заслужені діячі науки і техніки України, академік УААН та РАСГН І.І. Мартиненко, професори Г.Б. Іноземцев, Б.Х. Драганов, М.О. Корчемний, Б.І. Котов, В.П. Лисенко, В.І. Мішин, М.Т. Лут, Т.П. Резніченко, В.В. Козирський, Л.С.Червінський, доценти з багаторічним досвідом роботи: А.В. Міщенко, Г.М. Борщ, Б.Л. Головінський, Є.Л. Жулай, С.П. Коханівський, Ю.М. Лавріненко, В.О. Лазоренко, В.І. Солоний, В.Г. Тракай, М.О. Чуєнко та ін.

Основними проблемами, над вирішенням яких працює колектив факультету, є: розробка енерго- та ресурсоощадних технологій для сільськогосподарського виробництва; підвищення експлуатаційної надійності енергетичного обладнання та засобів автоматики; автоматизація технологічних процесів у сільському господарстві; електротехнології зберігання продукції; електротехнології на основі нетрадиційних матеріалів — сплавів з ефектом пам’яті форми; енергозбереження та використання нетрадиційних і поновлюваних джерел енергії. Факультет та центр плідно співпрацюють з інститутом електродинаміки НАН України, Національним центром «Інститутом механізації та електрифікації сільського господарства» УААН, інститутом «Укрсільенергопроект», та рядом інших наукових закладів та проектних установ.

У рамках програми співробітництва Національного аграрного університету з університетами США (штати Айова, Індіана) факультет співпрацює з їх відповідними підрозділами і має погоджені навчальні плани. На факультеті діє спеціалізована вчена рада із захисту кандидатських та докторських дисертацій зі спеціальностей 05.09.16 — «Електротехнології та електрообладнання в АПК». За час існування факультету підготовлено понад 10 тисяч інженерів-електриків, 20 докторів та близько 80 кандидатів наук. Гордість факультету — його кращі випускники, серед яких: Герой Соціалістичної Праці З.Л. Сірий, генерал-майор О.В. Власов (загинув у роки Великої Вітчизняної війни), повний кавалер ордена Слави П.Х. Тесмінецький, професори А.М. Лучук, М.Ф. Сагач, І.В. Хоменко, доктори технічних наук Г.Б. Іноземцев, М.О. Корчемний, О.І. Мартиненко.

Серед кращих випускників факультету є керівники електроенергетичного комплексу України — заступник держсекретаря Міністерства палива та енергетики України Ю.А. Андрійчук, голова правління ВАТ «Кивсільелектро» В.І.Іванчук — золотий спонсор факультету та Національного аграрного університету. У 2002 році розпочато проектування добудови восьмого навчального корпусу, фінансування проектних робіт здійснює ВАТ «Київсільелектро».

Факультет та центр енергетики і автоматизації АПК мають значні досягнення у науково-дослідній роботі, де поряд із досвідченими вченими випробовують свої сили і студенти. З року в рік активно ведеться винахідницька та раціоналізаторська робота.

Навчальним планом передбачена змістовна комп’ютерна підготовка студентів, оволодіння сучасними комп’ютерними технологіями. Студенти факультету неодноразово виборювали чільні місця на Всеукраїнській студентській олімпіаді з програмування.

Співробітниками центру видано понад 60 підручників і навчальних посібників, близько 25 монографій, більше тисячі наукових статей, отримано низку авторських свідоцтв і патентів на винаходи.

Фахову підготовку здійснює професорсько-викладацький склад п’яти кафедр, що входять до навчально-наукового центру енергетики та автоматизації АПК.